Se seu cliente não pagar um boleto recorrente:
São aplicados multa e juros, se estiverem configurados;
O cliente pode pagar até 60 dias após o vencimento, se o boleto tiver sido configurado para aceitar pagamento após o vencimento;
Se você configurar lembretes de cobrança, serão enviados e-mails nos períodos selecionados de vencimento (exemplo: 2 dias após o vencimento);
A recorrência continuará ativa e os próximos boletos serão gerados normalmente.